基因測序新方法為研究HPV相關腫瘤的起源開闢新路徑

宮頸癌每年奪走超過31.1萬人的生命，而其中的關鍵原因是人乳頭瘤病毒（HPV）在其基因組上的整合。

近期，華中科技大學同濟醫學院黃曉園教授團隊在國際知名期刊《BMC Genomics》上發表了題為“Long-read sequencing reveals the structural complexity of genomic integration of HPV DNA in cervical cancer cell lines”的重要研究成果，他們通過對所獲得的序列資料進行深度剖析，揭示了HPV整合現象的高度複雜性。

研究團隊通過運用長測序技術，不僅精確識別出HPV整合的斷裂點，而且證實其在準確性方面可媲美常規的高通量測序（NGS）方法。此項研究更進一步構建了詳盡的複雜整合基因組結構模型，其中包含了HPV基因組及臨近人類基因組區域的詳細資訊。

研究者們還在HPV整合中斷點周圍的人類基因組和HPV基因組序列中發現了微同源性片段，這提示了微同源重組可能參與了HPV整合過程。

黃曉園教授團隊憑藉PacBio長測序技術成功建立了SiHa和HeLa細胞中HPV整合基因組的精細結構模型，揭示HPV病毒如何複雜而深刻地影響宮頸癌，並提出SiHa細胞中染色體13上的結構變異可能與基因表達調控的關係。這些重大發現深化了大家對HPV16和HPV18整合過程的理解，為發現宮頸癌發展的分子機制以及潛在治療靶點奠定了堅實的基礎。研究強有力地證明了長測序技術在探測和解析HPV基因組整合結構上的巨大潛力和價值，為研究HPV相關腫瘤的起源開闢了新路徑。
 
 

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